Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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