Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Cldn34c1Q8K193 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Cldn34c1Q8K193 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn34c1Q8K193 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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