Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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