Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms