Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf170Q8CBG9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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