Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms