Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Btg4-201ENSMUST00000114431 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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