Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrtm1Q8BXQ3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms