Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms