Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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