Protein–RNA interactions for Protein: Q8BME9

Cbln4, Cerebellin-4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbln4Q8BME9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Cbln4Q8BME9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cbln4Q8BME9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms