Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6bQ8BKI2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms