Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smarcal1Q8BJL0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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