Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg4bQ8BGE6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms