Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H2-M10.4Q85ZW8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H2-M10.4Q85ZW8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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