Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.2 ms