Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnf1Q7TSH7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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