Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms