Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf139Q7TMV1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf139Q7TMV1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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