Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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