Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms