Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gramd2bQ6PEM6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms