Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms