Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pkp4Q68FH0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pkp4Q68FH0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pkp4Q68FH0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pkp4Q68FH0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkp4Q68FH0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms