Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5dQ62240 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5dQ62240 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms