Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema3cQ62181 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3cQ62181 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms