Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Traf3Q60803 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3Q60803 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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