Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tsr1Q5SWD9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms