Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psme4Q5SSW2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms