Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpkowQ56A08 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpkowQ56A08 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpkowQ56A08 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GpkowQ56A08 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms