Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Lrrc47Q505F5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Lrrc47Q505F5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms