Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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