Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc3lQ4KL14 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms