Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1nQ497L1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms