Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms