Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC051142Q3V0M8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms