Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms