Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms