Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim15Q3UTD9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms