Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fchsd2Q3USJ8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms