Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec31aQ3UPL0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms