Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms