Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms