Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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