Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Q3U1D9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U1D9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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