Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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