Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ptcd3Q14C51 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ptcd3Q14C51 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ptcd3Q14C51 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ptcd3Q14C51 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ptcd3Q14C51 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptcd3Q14C51 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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