Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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VgfQ0VGU4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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VgfQ0VGU4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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VgfQ0VGU4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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VgfQ0VGU4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms