Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms