Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms