Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tgm3Q08189 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms